它将整合相关的教学与科研资源，发展新兴边缘学科；培养满足社会需要的高素质复合型人才；加强国际和区域合作，为海洋与海岸带地区可持续发展提供决策支持，为厦门建成国际知名的海洋城市作贡献。
研究院将致力于研究海洋与海岸带地区可持续发展的前沿科学。研究领域主要包括：基于生态系统的海岸带（流域）综合管理、海洋经济发展、海洋政策与法律、环境责任、海岸带和谐社会构建、海洋监测和管理信息系统以及为政府决策服务的各种科技支撑，同时为国内外海洋资源开发与环境管理人才培训提供服务
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